Las organizaciones sociales tienen dos visiones bien diferenciadas sobre el modelo de desarrollo que quieren para el departamento. Una es liderada por la Red Caquetá Paz en la que participan campesinos, empresarios y sector público, la otra está representada por Caguán Vive, ubica en San Vicente del Caguán, que defiende un modelo de economía campesina.  Los resguardos indígenas, las asociaciones de mujeres y la Pastoral Social de la Iglesia Católica tienen también una injerencia importante en algunos municipios caquetenses.

Las organizaciones piden que se tengan en cuenta los avances logrados en los proyectos agroindustriales y denuncian la corrupción y la falta de instituciones estatales en zonas donde las Farc han tenido una presencia histórica. Para algunas organizaciones, la presencia cada vez mayor de ganadería extensiva y explotación minera amenazas la vocación amazónica de la tierra.

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