La Unidad de Víctimas retomó varios de los casos que había documentado la antigua Comisión Nacional de Reparación y Reconciliación (Cnrr) y la Unidad de Justicia y Paz de la Fiscalía. También trabaja con comunidades étnicas y campesinas, así como organizaciones de mujeres, periodistas y del movimiento sindical, que exigen la reparación colectiva como víctimas del conflicto armado colombiano. El trabajo con estos últimos es a nivel nacional.
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Santander
Caso 1
Municipios: El Peñón, Landázuri, Bolívar, Cimitarra, Sucre y La Belleza
Comunidad: Asociación de Trabajadores Campesinos del Carare, Atcc
Caso 2
Municipio: Charalá
Comunidad: habitantes el corregimiento de Riachuelo
Chocó
Caso 1
Municipio: Carmen del Atrato
Comunidad: vereda de Guaduas
Caso 2
Municipio: Carmen de Atrato
Comunidad: resguardo indígena La Puria
Bolívar
Caso 1
Municipio: San Juan de Nepomuceno, Mampuján, Las Brisas, San Cayetano y El Loro
Comunidad: Montes de María
Caso 2
Municipio: San Jacinto
Comunidad: habitantes del corregimiento Las Palmas
Caso 3
Municipio: El Peñón
Comunidad: Habitantes de la parcelación Las Pavas, en el corregimiento de Buenos Aires.
Caso 4
Municipio: Carmen de Bolívar
Comunidades: de la Alta Montaña
Antioquia
Caso 1
Municipio: San Carlos
Comunidad: habitantes del municipio
Caso 2
Municipios: El Bagre, vereda Villagrande corregimiento de Puerto López
Comunidad: Consejos Comunitarios Afrodescendientes del corregimiento de Puerto López
Caso 3
Municipio: San Francisco
Comunidad: Habitantes del corregimiento de Aquitania
Córdoba
Caso 1
Municipio: Montería
Comunidad: Comunidad educativa de la Universidad de Córdoba
Sucre
Caso 1
Municipio: San Onofre
Comunidad: Habitantes de Libertad
Caso 2
Departamentos: Bolívar y Sucre
Municipio: Los que componen los Montes de María
Comunidad: Organización de Mujeres de los Montes de María Narrar y Vivir.
Putumayo
Caso 1
Municipio: Valle del Guamuez
Comunidad: Habitantes de El Tigre
Caso 2
Municipios: Valle del Guamuez
Comunidad: habitantes de la inspección de policía El Placer compuesta por las veredas de Varadero, Brisas del Palmar, Los Ángeles, La Esmeralda, Mundo Nuevo, Cosa Rica, San Isidro, El Jardín y Guisía.
Norte de Santander
Caso 1
Municipio: área metropolitana de Cúcuta
Comunidad: colectivo de Asociación de Familias Unidas por el Conflicto Armado en Norte de Santander, Asfucans.
Caso 2
Municipio: El Zulia
Comunidad: organización de mujeres campesinas, negras e indígenas organizadas en Anmucic.
Tolima
Caso 1
Municipio: Valle de San Juan
Comunidad: habitantes de la vereda El Neme
Magdalena
Caso 1
Municipios: Chibolo, Plato y Sabanas de San Ángel
Comunidad: habitantes de las parcelaciones de La Pola y La Palizúa
Risaralda
Caso 1
Municipios: Mistrató y Pueblo Rico
Comunidad: reguardos indígenas unificados Embera Chamí, Gito Docabú y Citabara La Loma.